В отделении малоинвазивной хирургии проводятся диагностика и лечение врожденных и приобретённых пороков развития органов и систем в области шеи, грудной клетки (пищевод, диафрагма, трахеобронхиальное дерево, легкие), брюшной полости, в том числе заболеваний печени, поджелудочной железы и аноректальной области, с использованием щадящих методов.
В своей работе врачи отделения используют современное оборудование таких ведущих зарубежных компаний, как Karl Storz, Covidien, GE, Pentero.
Врачи отделения оказывают высококвалифицированную и качественную медицинскую помощь детям, используя возможности телемедицины, проводя видео консультации со специалистами из ведущих центров США, Канады, Англии, Германии и Кореи.